Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc47Q9D024 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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