Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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Usp38Q8BW70 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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Usp38Q8BW70 Gm24458-201ENSMUST00000083204 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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Usp38Q8BW70 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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Usp38Q8BW70 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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