Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
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NipblQ6KCD5 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
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NipblQ6KCD5 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
NipblQ6KCD5 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NipblQ6KCD5 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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