Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Pan3Q640Q5 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Pan3Q640Q5 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pan3Q640Q5 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pan3Q640Q5 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pan3Q640Q5 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pan3Q640Q5 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pan3Q640Q5 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pan3Q640Q5 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pan3Q640Q5 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Pan3Q640Q5 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Pan3Q640Q5 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Pan3Q640Q5 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Pan3Q640Q5 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms