Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm24579-201ENSMUST00000103964 144 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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