Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Ccdc185Q3V118 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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Ccdc185Q3V118 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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Ccdc185Q3V118 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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Ccdc185Q3V118 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Ccdc185Q3V118 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms