Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms