Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Usp19Q3UJD6 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Usp19Q3UJD6 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Usp19Q3UJD6 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Usp19Q3UJD6 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp19Q3UJD6 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Usp19Q3UJD6 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Usp19Q3UJD6 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms