Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Nkx6-3Q3UHX8 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Nkx6-3Q3UHX8 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.5 ms