Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Q3U6N9 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Q3U6N9 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.57□□□□□ -2
Q3U6N9 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Q3U6N9 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Q3U6N9 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Q3U6N9 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms