Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Trim71Q1PSW8 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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