Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 D3Ertd254e-201ENSMUST00000165956 6503 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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ptchd1Q14B62 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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