Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm27520-201ENSMUST00000184872 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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