Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RxraP28700 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RxraP28700 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RxraP28700 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 390.9 ms