Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm45374-201ENSMUST00000211388 136 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm25309-201ENSMUST00000116728 126 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 AC113441.1-201ENSMUST00000223464 134 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 AC124196.2-201ENSMUST00000224835 145 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm26303-201ENSMUST00000116845 119 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Sptan1P16546 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Sptan1P16546 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Sptan1P16546 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Sptan1P16546 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Sptan1P16546 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Sptan1P16546 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
Sptan1P16546 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Sptan1P16546 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms