Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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Nedd9O35177 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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Nedd9O35177 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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Nedd9O35177 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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Nedd9O35177 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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Nedd9O35177 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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Nedd9O35177 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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Nedd9O35177 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Nedd9O35177 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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