Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Cyp2j7-ps1-201ENSMUST00000122430 173 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Mir664-201ENSMUST00000196796 69 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm23216-201ENSMUST00000179545 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm22197-201ENSMUST00000116866 58 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Mir467e-201ENSMUST00000103760 87 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm27297-201ENSMUST00000183395 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NebE9Q1W3 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms