Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Zfp558E9Q1J0 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Zfp558E9Q1J0 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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