Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Gm22213-201ENSMUST00000157564 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Spocd1B1ASB6 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm25089-201ENSMUST00000102015 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm25840-201ENSMUST00000177821 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm24952-201ENSMUST00000177909 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm23682-201ENSMUST00000178146 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm24652-201ENSMUST00000178223 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm22629-201ENSMUST00000178272 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm24021-201ENSMUST00000178435 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm22274-201ENSMUST00000178441 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Spocd1B1ASB6 Gm22050-201ENSMUST00000178442 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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