Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm24414-201ENSMUST00000083434 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm24803-201ENSMUST00000083693 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm22580-201ENSMUST00000083727 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm24260-201ENSMUST00000083741 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm22682-201ENSMUST00000083854 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm28016-201ENSMUST00000184594 196 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Grik3B1AS29 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 348.1 ms