Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rtf1A2AQ19 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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