Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Nphp1Q9QY53 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Nphp1Q9QY53 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms