Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trpc5Q9QX29 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trpc5Q9QX29 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms