Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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