Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Olfr437-202ENSMUST00000205175 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Ubl5-209ENSMUST00000161882 489 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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