Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm29140-201ENSMUST00000190187 476 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
RabggtaQ9JHK4 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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