Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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Ccdc39Q9D5Y1 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
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Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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