Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC069074.1-201ENSMUST00000220048 381 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc47Q9D024 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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