Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TrabdQ99JY4 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TrabdQ99JY4 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms