Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm44373-201ENSMUST00000196112 169 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssh3Q8K330 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssh3Q8K330 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssh3Q8K330 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssh3Q8K330 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssh3Q8K330 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssh3Q8K330 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssh3Q8K330 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssh3Q8K330 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssh3Q8K330 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssh3Q8K330 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssh3Q8K330 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssh3Q8K330 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssh3Q8K330 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms