Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Atg4aQ8C9S8 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Atg4aQ8C9S8 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Atg4aQ8C9S8 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Atg4aQ8C9S8 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Atg4aQ8C9S8 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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