Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm26032-201ENSMUST00000178535 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25210-201ENSMUST00000178813 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25157-201ENSMUST00000178914 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm22046-201ENSMUST00000179027 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Usp38Q8BW70 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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