Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm22951-201ENSMUST00000179471 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Cldn34b3Q80ZS5 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.2 ms