Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm25832-201ENSMUST00000104140 130 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps6-202ENSMUST00000202526 135 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm26080-201ENSMUST00000104069 131 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm25423-201ENSMUST00000157609 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Sft2d1Q5SSN7 Olfr867-203ENSMUST00000216538 4617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Sft2d1Q5SSN7 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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