Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim71Q1PSW8 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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