Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm43829-201ENSMUST00000196191 3802 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ptchd1Q14B62 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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