Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Mir7661-201ENSMUST00000197023 61 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxd1Q01822 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms