Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PtprmP28828 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PtprmP28828 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PtprmP28828 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Mir224-201ENSMUST00000083608 82 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PtprmP28828 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PtprmP28828 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PtprmP28828 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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