Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PdgfraP26618 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PdgfraP26618 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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