Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tnnt1O88346 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tnnt1O88346 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tnnt1O88346 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tnnt1O88346 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tnnt1O88346 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tnnt1O88346 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Tnnt1O88346 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Tnnt1O88346 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms