Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Nedd9O35177 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Nedd9O35177 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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