Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Scarb2O35114 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Scarb2O35114 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Scarb2O35114 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.55□□□□□ -2
Scarb2O35114 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Scarb2O35114 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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