Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ArxO35085 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ArxO35085 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ArxO35085 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ArxO35085 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
ArxO35085 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
ArxO35085 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
ArxO35085 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
ArxO35085 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ArxO35085 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ArxO35085 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ArxO35085 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ArxO35085 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ArxO35085 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ArxO35085 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ArxO35085 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ArxO35085 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ArxO35085 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ArxO35085 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ArxO35085 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ArxO35085 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ArxO35085 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ArxO35085 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ArxO35085 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ArxO35085 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ArxO35085 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ArxO35085 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ArxO35085 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ArxO35085 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ArxO35085 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ArxO35085 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
ArxO35085 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ArxO35085 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ArxO35085 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ArxO35085 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ArxO35085 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ArxO35085 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
ArxO35085 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms