Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm22522-201ENSMUST00000158271 151 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 mt-Tm-201ENSMUST00000082395 69 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC0.04□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm26484-201ENSMUST00000158018 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CenpfE9Q3P4 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms