Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rtf1A2AQ19 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms