Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col4a3Q9QZS0 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col4a3Q9QZS0 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col4a3Q9QZS0 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Col4a3Q9QZS0 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col4a3Q9QZS0 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Col4a3Q9QZS0 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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Col4a3Q9QZS0 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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Col4a3Q9QZS0 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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Col4a3Q9QZS0 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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Col4a3Q9QZS0 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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Col4a3Q9QZS0 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col4a3Q9QZS0 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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