Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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Cln8Q9QUK3 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Cln8Q9QUK3 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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