Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Rabgef1Q9JM13 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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