Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm27535-201ENSMUST00000183814 157 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm23461-201ENSMUST00000083265 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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