Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc39Q9D5Y1 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Ccdc39Q9D5Y1 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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Ccdc39Q9D5Y1 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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